(если меня громко упомянуть в ЖЖ - я могу и появиться)

Тут прежде чем пробовать алгоритм - хорошо бы на сами данные посмотреть.

В частности, вот эта вот регулярная хрень в светах на картинке - в исходных данных нет такой же хрени?
Если есть, то чего на байера (демозаику) пенять, ей че дали, то она и сделала.

Если вы умеете выгнать эти данные в дамп (без заголовка, ну там 16 бит на пиксель) - RawDigger сумеет их прочитать (см. раздел Support of non-standard cameras в его мануале в разделе настроек).

Ну или дайте пару файликов для опытов, гляну.